В соответствии с Приказом Министерства природных ресурсов и экологии Российской Федерации от 05 августа 2019 г. № 522 «О реорганизации федеральных государственных бюджетных учреждений находящихся в ведении Федерального агентства водных ресурсов» ФГУ «ВерхнеОбьрегионводхоз» реорганизовалось путем присоединения к Федеральному государственному бюджетному водохозяйственному учреждению «Центррегионводхоз».

Действующее наименование учреждения Филиал «ВерхнеОбьрегионводхоз» ФГБВУ «Центррегионводхоз»